Kako mogu riješiti sumnju u razliku između konkurentne i nekonkurentne inhibicije enzima?


Odgovor 1:

Konkurentski inhibitori vežu se na dio aktivnog mjesta koji veže supstrat i blokira pristup supstratu.

Dok se nekompetitivni inhibitori (UI) vežu samo na enzimski-supstratni kompleks (ES) na mjestima koja su različita od mjesta vezivanja supstrata. Korisničko sučelje se ne može vezati na besplatni enzim jer za to nema mjesto vezanja ili stranica još nije dostupna. Vezivanje supstrata za enzim inducira konformacijsku promjenu enzima zbog čega je mjesto vezivanja dostupno korisničkom sučelju.

Kako se veže za ES, on uzrokuje smanjenje učinkovite koncentracije ES kompleksa, čime se povećava enzim očit afinitet za supstrat po principu Le Chateleira (Km je spušten) i smanjuje Vmax, kao što je vidljivo iz Lineweaver-Burk zavjera o korisničkom sučelju ,

U natjecateljskoj inhibiciji Vmax je nepromijenjen, dok je prividni afinitet supstrata prema mjestu vezivanja smanjen, Km raste.

Izvor slike: Google.

PS: Ako ste početnik, zaboravite zavjere jer mogu komplicirati stvari. Jednostavno zapamtite da se CI veže na besplatni enzim na aktivnom mjestu dok se UI veže na ES kompleks na mjestu koje nije aktivno mjesto.

Nadam se da ovo pomaže.


Odgovor 2:

Morate pogledati sheme reakcija. Ove su slike uzete iz članka wikipedije: Inhibitor enzima - Wikipedija

Ako se to čini neshvatljivim, to je zato što gore prikazane sheme gotovo nikada ne odražavaju stvarnost. Nekompetitivna, nekonkurentna i mješovita inhibicija nalaze se u reakcijama s 2 supstrata, npr. A + B → C + D, gdje enzim ima mjesto vezanja za A i mjesto vezanja za B.

Kinetički eksperimenti izvode se držanjem jedne podloge konstantnom u nizu reakcijskih epruveta, a drugom izmjenom. Pretpostavimo da se B drži konstantnim i mjerimo v prema [A]. Dobivate hiperboličku krivulju. Dodajte konkurentski inhibitor A, nazovite ga

IAI_{A}

, i vidjet ćete natjecateljsku inhibiciju. Dodajte konkurentski inhibitor B,

IBI_{B}

i vidjet ćete jedan drugi oblik inhibicije.

Većina udžbenika ne objašnjava da su potrebne reakcije 2-supstrata za natjecateljsku, nekonkurentnu i miješanu inhibiciju. Koliko znam, radi samo Lehninger ("Lehninger", Nelson i Berg).

Jednog dana nacrtat ću reakcijsku shemu za reakcije s 2 supstrata i objaviti je.